5 марта 2009 года в Троице-Сергиевой Лавре прошло первое заседание Общественно-попечительского совета Кронштадтского Морского собора под патронатом супруги Президента РФ С.В. Медведевой и по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла.
Председателем Общественно-попечительского совета Кронштадтского Морского собора избран Заместитель Руководителя Администрации Президента РФ А.Д. Беглов, секретарем – глава администрации Кронштадтского района Санкт-Петербурга А.М. Горошко. Принято решение о необходимости создания Международного благотворительного фонда «Кронштадтский Морской собор во имя Святителя Николая Чудотворца», определены его основные цели и задачи, принципы работы.
16 мая 2009 года в Кронштадтском Морском соборе в присутствии супруги Президента России С.В.Медведевой и губернатора Санкт-Петербурга В.И.Матвиенко подписаны учредительные документы Некоммерческой организации «Международный благотворительный фонд «Кронштадтский Морской собор во имя Святителя Николая Чудотворца», утвержден Устав Фонда и сформированы органы Фонда:
Целями Фонда являются:
- Воссоздание, должное содержание, эксплуатация и охрана памятника истории и культуры — Кронштадтского Морского собора во Имя Святителя Николая Чудотворца (далее — Собор).
- Воссоздание, должное содержание, эксплуатация и охрана иных объектов и территорий, имеющих историческое, культовое и культурное значение.